Para quem precisar cortar algum arquivo de áudio uma boa dica é o programa Split MP3, que faz esse trabalho rapidamente em vários formatos como: MP3, WAV, AAC, WMA, FLAC, M4A e AC3. Você também pode modificar a qualidade final e alterar o bitrate.

Ele serve apenas para cortar os arquivos de áudio MP3 e é gratuito.